Progetti

GENOMAeSALUTE è un progetto per la creazione in Regione Campania, presso il campus Universitario di Medicina dell’Università degli Studi di Salerno a Baronissi, di un Centro di Ricerca Genomica per la Salute (CRGS), la prima grande infrastruttura di ricerca e sviluppo italiana ad alta capacità dedicata alla ricerca genomica e informatica traslazionale per la salute, in particolare per l’oncologia e la medicina di precisione. La dotazione tecnologica e ICT dell’infrastruttura proposta è stata progettata per fornire elevate prestazioni in genomica (NGS) e bioinformatica e per permettere di generare, studiare con metodologie innovative per analisi di ‘big data’ e conservare in sicurezza grandi volumi di dati di sequenziamento e biomedici, al fine di rendere possibili grandi progetti nazionali ed internazionali di genomica e medicina di precisione, mettendo nel contempo a disposizione della comunità biomedica ed i sistemi sanitari regionale e nazionale e dell’industria una concentrazione di tecnologie di sequenziamento del DNA e competenze tecnico-scientifiche ad oggi non disponibile in Italia.

Codice progetto:

POR FESR 2014-2020 INFRASTRUTTURA

Valore totale:

10.000.000,00 €

Scadenza:

31 Marzo 2023

RISULTATI ATTESI:

Il progetto punta alla creazione dell’infrastruttura strategica campana di ricerca traslazionale sul genoma per la lotta ai tumori e la salvaguardia e miglioramento della salute umana. Il partenariato di GENOMAeSALUTE comprende due Università campane, due grandi aziende operanti nel settore sanitario e due PMI del settore delle biotecnologie, che si sono riunite per produrre ricerca e innovazione in genomica, bioinformatica e nell’analisi di grandi dati e, nel contempo, consentire il trasferimento dei risultati al settore pubblico e privato della salute. I campi di ricerca dell'infrastruttura saranno la generazione e analisi di grandi e complessi dati derivanti dal sequenziamento su larga scala di genomi, epigenomi, trascrittomi e metagenomi, allo scopo di identificare una nuova generazione di informazioni e strumenti utili in medicina predittiva e preventiva, fornendo tecnologie complementari alle biobanche regionali, nazionali e internazionali esistenti.

Con il progetto Daria “Deconvoluzione Ai-Driven Di Popolazioni Di Progrenitori Chemio-Resistenti Nella Leucemia Mieloide Acuta” Biogem studia come le cellule leucemiche evolvono nel tempo, acquisendo mutazioni che le rendono sempre più aggressive. La leucemia mieloide acuta (AML) è un tipo di tumore del sangue che nasce nelle cellule del midollo osseo, dove vengono prodotte le cellule del sangue. Questa malattia è molto complessa e coinvolge diverse tipologie di cellule mieloidi altamente immature. Uno dei problemi principali è che alcune di queste cellule, progenitori multipotenti, tendono ad espandersi troppo e a resistere ai trattamenti, aumentando il rischio di recidive e peggiorando la prognosi.

Codice progetto:

PE_00000019

Valore totale:

400.000 €

Durata:

13/05/2025 -12/11/2025

RISULTATI ATTESI:

Nel corso del progetto, Biogem, prevede di sviluppare nuovi metodi basati sull’AI per monitorare queste cellule, capire quando aumentano e quali caratteristiche hanno, così da poter intervenire prima che la malattia si aggravi. Si utilizzeranno nuove tecnologie di sequenziamento (epi)genetico, combinandole con algoritmi di intelligenza artificiale. Si analizzeranno anche singole cellule per avere un quadro molto più preciso dello stato della malattia. Riuscendo ad individuare precocemente l’espansione delle cellule più aggressive e resistenti, si potrà intervenire prima che la leucemia diventi molto aggressiva o resistente ai farmaci. Inoltre, identificando i geni e i percorsi molecolari (pathways) coinvolti in questa resistenza, si potranno sviluppare nuove terapie più efficaci e personalizzate per i pazienti affetti da AML.

Progetto cofinanziato dall’Unione europea, Fondo europeo di sviluppo regionale - Programma Operativo Nazionale Imprese e Competitività 2014-2020

ASSE I Priorità di investimento 1b Azione 1.1.3

Decreto di concessione: n. 2247 del 13/07/2018

Il progetto punta ad una innovazione di prodotto nel campo biofarmaceutico (molecole e anticorpi candidati alla diagnosi e alla cura di patologie oncologiche). L’applicazione dei risultati del progetto può contribuire alla promozione di un’industria evoluta con crescita economica del settore dell’Healt and Medicine, basata sulla diffusione della conoscenza e sull’innovazione, per andare incontro alle esigenze del panorama di una patologia rara, come il mesotelioma pleurico, che solo in Italia colpisce più di 1000 persone l’anno. L’obiettivo del presente progetto è lo sviluppo preclinico di molecole ad attività antitumorale in pazienti affetti da MPM caratterizzati per uno specifico profilo biomolecolare. Inoltre, l'identificazione di nuovi biomarker permetterà di sviluppare, mediante l'utilizzo di biotecnologie avanzate, innovativi strumenti diagnostici in grado di adattarsi dinamicamente alle crescenti richieste nel campo della medicina predittiva e personalizzata.

Codice progetto:

N. F/090019/01/X36

CUP B98I17000650008

Valore totale:

Costo del progetto €. 6.069.984,38

Finanziamento concesso €. 4.992.309,21

Scadenza:

48 mesi a partire dal 02/10/2017

RISULTATI ATTESI:

L’obiettivo finale del progetto ed i relativi risultati attesi sono raggruppabili nella realizzazione di due piattaforme tecnologiche, una Chimica ed una Biotecnologica, strettamente interconnesse e relative all'identificazione e caratterizzazione di nuove molecole e anticorpi monoclonali per la terapia e diagnosi di mesotelioma pleurico.
Nel complesso, l’impatto atteso dalla ricerca proposta sarà quello di produrre innovazione dal punto di vista terapeutico e traslazionale riempendo i gap nelle conoscenze scientifiche su questo tumore.
Infine, va sottolineato che l’obiettivo finale del progetto è l’individuazione di uno o più prodotti da sviluppare a livello preclinico da indirizzare alle fasi di studi clinici, creando il presupposto per lo sviluppo industriale e per l’avvento di nuove terapie nel campo del trattamento del mesotelioma, con conseguenti significative ricadute di interesse socio-sanitario. La realizzazione della sperimentazione clinica, dopo completamento di questo progetto, potrà essere attuata mediante accordi di licenza con le aziende farmaceutiche con cui Biogem già realizza progetti di collaborazione
L'individuazione di nuovi biomarker permetterà di sviluppare un protocollo/kit di ampio utilizzo che consenta di arrivare ad un inquadramento diagnostico dell’istotipo di mesotelioma mediante un semplice prelievo di sangue piuttosto che tramite biopsia.
Il progetto avrà come fine ultimo quello di produrre e commercializzare un nuovo kit per la diagnosi di mesotelioma portando sul mercato un nuovo prodotto con forti potenzialità commerciali poiché in grado di fornire un approccio non solo di tipo diagnostico, ma anche di tipo prognostico e predittivo.

RISULTATI RAGGIUNTI:

Il progetto si proponeva di raggiungere due differenti obiettivi derivanti dalle attività previste nell’ambito delle due piattoforme di ricerca proposte: Piattaforma Chimica e Piattaforma Biotecnologica.

Piattaforma chimica: Obiettivi dichiarati

Sviluppo preclinico di almeno 1 molecola “Drug Candidate” (completamento studi di tossicologia regolatoria) con produzione della Investigational broushure o dossier regolatorio (IB), necessaria per l’autorizzazione agli studi clinici di FaseI. Le caratteristiche del Drug Candidate Profile sono riassunte nella tabella seguente
Presentazione almeno 1 domanda di brevetto della classe di molecole a cui appartiene il Drug Candidate

Piattaforma chimica: Obiettivi raggiunti

Sono state analizzate per la loro attività antitumorale oltre 100 molecole. Tra queste, sono state selezionate 2 molecole MIR002 e GEM144 particolarmente attive nei diversi modelli tumorali analizzati. Le molecole hanno dimostrato la loro attività per via orale come da obiettivo progettuale. Le valutazioni di ADME in vitro e di Farmacocinetica in vivo hanno permesso di selezionare GEM144 come la molecola con il migliore profilo farmacologico e quindi focalizzare su questa molecola loSviluppo Preclinico.
La prima parte di questo sviluppo ha riguardato lo scale-up della molecola a livello industriale ottenendo alla fine tre batchesdi prodotto di grado clinico con una purezza superiore al 99% e con una stabilità in pratica del 100%a tre mesi.
Tali Batches sono stati usati per le valutazioni tossicocinetiche ai fini regolatori.
In particolare, sono stati effettuati in regime GLP valutazioni tossicologiche a tre livelli di dose in ratto in accordo con le presenti guideline europee.
Sono stati valutai agli stessi livelli di dose i parametri farmacocinetici della maolecola quali Cmax, T1/2 e AUC.
I risultati di tali analisi sono stati in linea con quanto atteso dagli esperimenti in vivo precedenti. La molecola è ben tollerata e solo ai dosaggi più alti induce una mielosoppressione di grado 2 reversibile dopo una settimana dall’interruzione del trattamento.
Questi risultati ci hanno permesso di determinare le dosi con le quali condurre la tossicologia sulla seconda specie, richiesta per gli studi regolatori al fine di produrre le informazioni per procedere agli Studi di Fase I sull’uomo. La seconda specie scelta è stata il minipig e questi studi sono tutt’ora in corso e saranno completati entro la fine del progetto.
Il raggiungimento in pratica di tutti gli obiettivi del progetto, e la realizzazione delle diverse attività sperimentali , sono alla base dei contenuti della Investigational broushure o dossier regolatorio (IB), che attualmente è in fase di scrittura.

2) Presentazione almeno 1 domanda di brevetto della classe di molecole a cui appartiene il Drug Candidate

Sono stati presentate una serie di domande di brevetto a cui ad oggi sono seguite concessioni in Europa, Stati Uniti, Russia e sono pending le domande in Cina e Giappone.

Si elencano i brevetti:

Brevetto Europeo n. EP N. 17772733.6 (fase nazionale del PCT) AZIONE UFFICIALE DEL 10/12/2020

FEDERAZIONE RUSSA – Domanda di brevetto n. 2019112675. Concessione n.: 2748838. Data di concessione: 31.05.2021

state

In USA è stata successivamente presentata una divisionale di questo brevetto al fine di proteggere in modo specifico GEM144. Domanda USA MBE14248-US-2 CIP USA N. 17/079,467 del 24/10/2020

Domanda brevetto in Cina n. 201780059048.1 (Ottobre2021)

Piattaforma Biotecnologica: Obiettivi dichiarati:

Identificazione, caratterizzazione di almeno 2 anticorpi monoclonali diretti contro proteine espresse in pazienti con MPM con affinità verso l’antigene di: >10^-7/10^-9
2 domande di brevetto per gli anticorpi generati
Sviluppo di un anticorpo monoclonale da utilizzare in immunocitochimica e/o in un kit diagnostico per la diagnosi di MPM
Sviluppo di un nuovo test diagnostico per la diagnosi non invasiva di MPM

Piattaforma Biotecnologica: Obiettivi raggiunti:

1) Sono stati identificate una serie di proteine come putativi marcatori del Mesotelioma Pleurico. Le proteine sono state clonate, espresse ed utilizzate per immunizzare topo per la produzione di monoclonali. Due degli anticorpi prodotti contro GDF15 e Pin1 si sono rivelati ad alta affinità nel riconoscimento degli antigeni specifici sia per immunoistochimica che per western blotting.

2) Per i due anticorpi prodotti sono attualmente in fase di scrittura due distinte domande di brevetto;

3) Utilizzando questi anticorpi abbiamo verificato su sezioni istologiche provenienti da pazienti con MPM la presenza delle due proteine. L’analisi ha rivelato che GDF15 è sicuramente associato alle cellule del tumore e quindi possiamo affermare che a livello diagnostico GDF15 potrà in futuro essere utilizzato come un nuovo biomarcatore per il mesotelioma pleurico. in uno dei tre istotipi di mesotelioma pleurico;

4) L’analisi condotta su 30 sieri di pazienti con MPM e 20 individui sani ci ha permesso di validare GDF15 come un nuovo biomarcatore presente a significative più alte concentrazioni nel plasma di pazienti con MPM rispetto a soggetti sani.

Tali analisi si sono avvalsi del nuovo kit da noi sviluppato per la detection nel plasma di GDF15

Il progetto si pone l'obiettivo di sviluppare un kit diagnostico basato sulla quantizzazione di biomarcatori molecolari nella saliva di pazienti con alto rischio di sviluppare carcinoma della laringe (LSCC) (diagnosi precoce) ed in pazienti con LSCC conclamato per monitorare la progressione della malattia e prevederne l’invasione linfonodale (valenza prognostica). I biomarcatori utilizzati saranno microRNA frequentemente deregolati in tali neoplasie. Tali biomarcatori sono stati individuati grazie a ricerche precedenti svolte dai proponenti. Il kIt diagnostico che si intende realizzare si baserà su una tecnologia innovativa che prevede l'utilizzo di nanofibre in diverso materiale in grado di funzionare come biosensori e rivelare attraverso diverse metodologie (colorimetriche, fluorescenza, spettrometria etc) la presenza di uno o più biomarcatori di interesse. Tale tecnologia permette il design di un dispositivo di facile utilizzo in ambito clinico, a costi relativamente bassi e di facile utilizzo.

Codice progetto:

POR FESR 2014-2020 TRASFERIMENTO TECNOLOGICO

Valore totale:

1.358.214,80€

Scadenza:

30 Novembre 2020

RISULTATI ATTESI:

Lo studio si propone di sviluppare un kit diagnostico in grado di rilevare e quantificare miRNA con valore diagnostico e prognostico (predizione di risposta ai trattamenti chirurgici e radioterapici) nel carcinoma squamocellulare della laringe (LSCC) (coinvolgimento linfonodale ed estensione TNM di malattia).
Il progetto consentirà lo sviluppo di nuove strategie diagnostiche in grado di determinare, mediante l’utilizzo di biosensori, la presenza di microRNA (biomarcatori) su tessuto tumorale e fluidi biologici (sangue,saliva) in grado di predire sia l’estensione di malattia che la risposta al trattamento.
Inoltre, la collaborazione con il Prof. Evzen Amler della CharlesUniversity di Praga permetterà di mettere a punto dei nanosensori basati sull’utilizzo di nanofibre di caprolattone funzionalizzati con probe di DNA fluorescenti. Lo sviluppo di nanosensori permetterà in maniera rapida di determinare la presenza di miRNA nei campioni biologici.
Il progetto intende quindi produrre nuove strategie diagnostiche, prognostiche e predittive di risposta al trattamento con un concomitante sviluppo di un avveniristico dispositivo basato su esclusive nanofibre con capacità di biosensing di molecole di interesse biologico.

Il progetto intende sviluppare una piattaforma di sensing integrata che comprenda due diverse soluzioni tecnologiche accomunate dalla natura del supporto (silicio poroso) e dal rilevamento del segnale di tipo ottico. Le piattaforme si differenzieranno per la natura delle biosonde. Esse saranno: 1) Sens-Chem. È una "Piattaforma di Sensing" per la determinazione diretta di contaminanti ambientali, potenzialmente cancerogeni, nelle acque irrigue, nei prodotti agricoli ed in fluidi biologici. La piattaforma includerà immunosensori ottici per la determinazione dei livelli dei contaminati e biosonde proteiche diverse (anticorpi, recettori, peptidi) capaci di riconoscere i contaminati in esame consentendone il rilevamento e la loro quantificazione; 2) Sens-Effect. E’ una "Piattaforma di Sensing" per la determinazione diretta e indiretta di contaminanti ambientali, potenzialmente cancerogeni, nei fluidi biologici. La piattaforma includerà sensori ottici per la determinazione dei livelli dei contaminanti attraverso biosonde proteiche (valutazione dell’alchilazione al DNA) e di acidi nucleici complementari a non-coding RNA (ncRNA) circolanti associati a diverse patologie oncologiche su base ambientale. Il progetto propone altresì lo sviluppo di un protocollo di valutazione ambientale. Le piattaforme di sensing sviluppate in GOOD WATER, con il relativo protocollo di valutazione ambientale, consentiranno agli utilizzatori di valutare il livello complessivo di alterazione ambientale di una determinata area geografica, e di porlo in relazione agli effetti sulla salute animale ed, in ultima analisi, umana.

Codice progetto:

POR FESR 2014-2020 TERRA DEL BUONO

Valore totale:

820.409,00€

Scadenza:

31 Ottobre 2019

RISULTATI ATTESI:
L'obiettivo finale del progetto è l'industrializzazione di una piattaforma di rilevamento di sostanze cancerogene e dei relativi protocolli di valutazione ambientale per l'istituzione di un sistema di allarme precoce per la prevenzione del cancro. La "Piattaforma di sensing" che si intende sviluppare sarà applicabile alla determinazione di contaminanti chimici sia nelle acque di falda, sia nei prodotti agricoli, sia nei fluidi biologici (animali di allevamento ed uomo).

Codice progetto:

POR FESR 2014-2020 INFRASTRUTTURA

Valore totale:

10.000.000,00 €

Scadenza:

31 Marzo 2023

RISULTATI ATTESI:

Progetti

COVID-19, OLTRE I TAMPONI: NUOVI STRUMENTI PER IL MONITORAGGIO DELL'EPIDEMIA E DELL'IMMUNITÀ

EPIGENIUS: BASI EPIGENETICHE VIRALI E DELL'OSPITE DI SUSCETTIBILITA' ALLA INFEZIONE DA SARSCOV-2

16.1.2 Azione 2 “Difesa del pomodoro campano nei confronti delle contaminazioni di Alternaria. Messa a punto di protocolli per il monitoraggio della filiera produttiva e di trasformazione e di strategie per la prevenzione delle contaminazioni da tossine di Alternaria” : DIPOCA

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SMART TEST: REALIZZAZIONE DI UN BIOSENSORE PER IL RICONOSCIMENTO DI ESOSOMI CIRCOLANTI PER LA DIAGNOSI PRECOCE DEI TUMORI DELLA TESTA E DEL COLLO

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RISULTATI ATTESI:

ADVANCED TECHNOLOGIES FOR HUMAN-CENTRED MEDICINE

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